Программное обеспечение для молекулярного моделирования, позволяющее эффективно выполнять различные задачи в химии и фармокологии.

Компания Chemical Computing Group (CCG) основана в 1994 году, в настоящее время штаб квартира базируется в Монреале, Канада. Основное направления деятельности компании сосредоточено на разработке спеиализированного программного обеспечения для решения задач вычислительной химии, bioinformatics, cheminformatics, docking, pharmacophore searching и молекулярного моделирования. Основные клиенты Chemical Computing Group (CCG) — фармацевтические и биотехнологические компании, а также научно-исследовательские группы.

В последнее десятилетие задача по поиску удачных активных молекул заметно упростилась благодаря компьютерному моделированию. Современные компьютерные программы (например, Molecular Operating Environment) позволяют создавать модели связывания активных веществ с рецепторами, изменения в молекуле при попадании в тело человека. Таким образом, уже на теоретическом этапе можно отобрать лишь те молекулы, которые с наибольшей вероятностью окажутся эффективны. При создании моделей можно учитывать очень много параметров, в том числе фильтры молекулярных дескрипторов, преобразование и расчёт трёхмерной структуры (c учётом минимизации энергии), создание вложенных баз конформеров для каждой структуры и многое др.
Только их и будут синтезировать, чтобы проверить их свойства в эксперименте. После базовых тестов, которые проводят «в пробирке» на изолированных мембранах, органах или тканях животных и человека, выбирают наилучший вариант. На этой стадии университетские или промышленные лаборатории обычно патентуют открытие и часто вступают в сотрудничество с более крупными исследовательскими центрами или фармацевтическими компаниями.
Основные возможности CCG Molecular Operating Environment 2009.10:

Real Time Ray-traced Graphics
• Visualize molecular systems with ray-traced quality in real time
• Create high quality images for posters and presentations
• Use multicolored backgrounds, new styles and focal blur effects
Scaffold Replacement/Fragment Linking
• Find new scaffolds, link R-groups or grow molecules
• Apply synthetic feasibility test
• Filter with 2D and 3D constraints (descriptors, fingerprints, pharmacophore)
MOE/web SOAP Server
• Deploy MOE functionality with the web SOAP protocol
• Integrate MOE into pipeline workflows
• Add custom SOAP functionality with SVL programs
LowModeMD Conformational Search
• Generate conformations from low frequency vibrational mode transitions
• Use novel implicit velocity filtering methodology for large systems
• Apply to small molecules, macrocycles, or protein loops
Synthetic Score Descriptor
• Perform extensive retrosynthetic disconnections
• Compare fragments to a starting materials database
• Report fraction of molecule reduced to starting materials
Protein/Antibody Modeling
• Create antibody models using the MOE/web interface
• Select antibody CDR geometry from pre-calculated clusters
• Align proteins with enhanced algorithm and interface
Operating Systems
* Windows 2000/XP/Vista/Windows 7
* Linux
* Mac OS X
* Sun Solaris 10 (Minimum Solaris 8)
* Silicon Graphics Irix 6.5
Название: CCG Molecular Operating Environment
Версия: 2009.10
Разработчик: www.chemcomp.com
Интерфейс: английский
Операционная система: многоплатформенная
Размер файла: 650.1mb

СКАЧАТЬ с обменника

    Поделитесь ссылкой с пользователями Google +1